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实验室设计主要包括燃气管道系统、通信系统、监控报警系统等。P2实验室设计主要包括16个主要系统设计，即：实验室结构、洁净度和压力梯度、气流组织方式、空调系统、送风和排风系统、压力显示和报警系统、电子联锁系统、风量自动控制系统、防气流倒流系统、货物进出、燃气管道连接、数据传输系统、监控系统、通信系统、门禁系统、分配系统形式和配置。

1. 实验室结构： P2实验室的吊顶与围护隔断材质，以聚苯乙烯夹心彩钢板为佳，厚度为50mm，这种材质不仅重量轻，而且机械强度高，同时具备极好的防水与保温性；墙与地面、墙与顶板之间夹角，这些地方要用铝合金圆弧阴阳过渡及密封，且要使用电泳型配套铝合金材料，以免因为长期实验导致铝材氧化;最后，地面要使用塑胶PVC地板进行无缝连接，这类材料具有耐酸碱腐蚀、抗磨损及防滑等特点。

2. 洁净度与压力梯度：P2实验室设计对于压力梯度的控制主要依据污染区及实验操作室两部分划分。